在海南投放强基计划的高校分别是:北京大学、清华大学、南京大学、复旦大学、同济大学、中山大学、哈尔滨工业大学、上海交通大学、浙江大学、中国科学技术大学、中国海洋大学、武汉大学、西安交通大学、北京航空航天大学。