1991年12月6日，省台办举行成立揭牌仪式。 　　1992年10月18日至20日，“海南省台商投资项目新闻发布会”举行。11月3日，省委、省政府办公厅联合下发《关于我省涉台事务由省台办归口管理的通知》。 　　1993年4月3日，海南省台资企业赴京参加“台资企业技术产品博览会”。江泽民总书记参观海南展厅。 　　1995年11月23日，省政府颁布实施《在琼台胞居民待遇问题的规定》。12月5日，全省琼台农业合作工作会议召开。 　　1996年10月7日—9日，台湾省农会率15个县市农会负责人来琼考察热带农业。 　　1998年10月22日，省公安厅下发《关于进一步做好台湾居民入出境管理工作的通知》，进一步放宽台湾同胞来琼出入境政策。12月25日，澳门航空公司开通“台北-澳门-三亚”一机到底航线。 　　1999年3月9日，“海峡两岸（海南）农业合作试验区”获准设立。 　　2000年7月25日，琼台农业大学生夏令营活动在琼举行。 　　2001年10月30日—11月4日，“琼台少数民族学术文化交流周”活动在琼举行。 　　2002年2月22日，《琼台姊妹岛》网站开通运行。 　　2003年2月24日至27日，第六届“海峡两岸旅游同业联谊会”在海口召开。8月7日，应省台办邀请，台湾少数民族海南省亲团一行来琼交流，并赴北京参访，在人民大会堂受到了中共中央政治局常委、全国政协主席贾庆林的亲切会见。 　　2004年，首届海峡两岸热带兰花博览会在三亚举行。 　　2005年4月9日—15日，海峡两岸各民族欢度“三月三”。4月22日至25日，两岸108位高僧大德出席三亚南山海上观音圣像开光大典。 　　2006年4月11日，中国国民党第一副主席吴伯雄来琼访问；10月17日，两岸农业合作论坛在博鳌开幕。 　　2007年8月15日，中国国民党屏东县委员会访问团抵琼进行交流访问。 　　2008年4月12日，中共中央总书记胡锦涛在博鳌会见了萧万长先生率领的台湾两岸共同市场基金会代表团一行。