根据合作协议，海南热带海洋学院将根据三沙市经济社会发展的实际需要，联合开办涉海新兴特色专业，发挥科技转化，在海洋科学与技术、海洋工程、发展战略、南海海洋科学基础研究、环南海旅游资源开发与合作、海洋生物医药资源、海洋油气资源开发利用等领域加强合作研究，共同申报创建国家级热带海洋协同创新研究中心， 培养三沙经济社会发展急需的专业人才。

　　同时，三沙市政府将支持海南热带海洋学院设立青年人才实践锻炼基地和学生教学实习实训基地，有计划接收该校青年老师和管理干部到相关部门任职或挂职锻炼，接收优秀学生赴三沙实习锻炼和义务支教，并支持该校开展南海科学考察科研，促进“政产学研用”结合。