吴士存建议，未来两岸南海合作应当坚持学术交流、维护机制、聚焦仲裁、等待时机、顺势而为，通过加强两岸专家学者交流和合作研究，共同应对仲裁裁决所带来的挑战。

　　刘复国认为，当前菲南海仲裁的法律过程虽暂告段落，但安全、外交层面影响逐步凸显，有关国家将日益突出以实际行动挑战两岸南海主张。他建议，多年来两岸南海学术交流机制在南海维权中扮演着重要的角色，两岸专家学者应围绕重点议题，开展建设性的研讨合作，凝聚共识，保持两岸在南海研究上的同步，为官方决策提供可操作性建议，并以实际行动展现两岸合作姿态。

　　据悉，“海峡两岸南海问题民间学术论坛”创立于2002年，已在琼台两地轮流举办了十三届涉南海问题学术研讨会。论坛已经成为两岸南海研究专家学者交流合作的机制化平台，为促进两岸民间学术交流、共同维护南海权益、推动两岸南海合作作出贡献，也受到了两岸各界的高度评价和支持。