检察机关在审查起诉阶段依法告知了被告人吴清新享有的诉讼权利，并讯问了被告人吴清新，听取了其委托的辩护人的意见。海口市检察院起诉书指控：被告人吴清新利用担任海口市军粮供应管理站主任的职务便利，为他人谋取利益，多次非法收受他人财物；为套取公款，以海口市军粮供应管理站的名义与私人企业签订虚假的储备粮仓库租金合同，非法占有公共财物；滥用职权，致使公共财产遭受巨大损失，依法应当以受贿罪、贪污罪、滥用职权罪追究其刑事责任。