管理办法指出，渔港建设必须符合全省渔港布局规划和渔港总体规划，渔港总体规划不仅要体现渔船停泊、避风、补给、交易、加工等生产功能，还应与休闲、娱乐、消费等旅游元素结合，提升渔港的综合功能和建设水平。

　　管理办法将渔港公益性设施和经营性设施进行了界定，明确指出：渔港公益性设施投资建设坚持“政府主导、规划先行、财政投入、行业主管部门监督实施”的原则，形成的资产属于国有资产，其管理按照国有资产监督管理有关规定实施；渔港经营性设施建设实行“谁投资、谁受益”的原则，由所在市县组织招商引资，吸引社会资本建设。

　　管理办法明确，不涉及国家安全和国家机密的非经营性政府投资渔港项目，将实行“代建制”，即通过招标等方式选择具备工程项目管理资质的工程咨询机构，作为项目管理单位，负责组织项目的建设实施。渔港项目的勘察、设计、施工、监理和与工程建设相关的重要仪器、设备、材料的采购要依法实行政府采购。