2016年海南省男子足球超级联赛于2016年9月17日开战，历时3个多月激战56场。经过激烈角逐，海口佳宁娜红色战车队以10胜3平1负积33分的优异战绩成功卫冕；两支学生军海南师范大学队和海南大学队分获亚军和季军；第四至第八名为万宁奔格内、三亚、澄迈雷霆、琼海京海成百盛、东方。冠军获得6万元奖金，亚军获奖4万元，季军获奖3万元，第四名奖金2万元，第五至第八名奖金均为1.5万元。