为发挥比较优势，崖州区明确“一港三城”的发展定位：深海科技城产业方向是海洋产业，重点是深海产业；南繁科技城产业方向是现代热带农业，重点是种业；大学城将引进一批在深海和南繁领域领先的国内外院校从事科研，推动产学研联动；崖州港则提供配套服务。围绕这样的定位，深海科技城开发与大学城开发相结合，南繁科技城开发与全球动植物种质资源引进中转基地开发相结合。

　　统计显示，2018年，崖州区完成固定资产投资45亿元，海洋科技馆·鲸世界、用友三亚产业园等项目建成投入使用，三亚海事工作船码头、南山安置区等11个重点项目全面开工。

　　2019年，崖州区固定资产投资计划为110.8亿元，1月至2月已完成投资约7.81亿元。目前，该区各项目完成征收补偿土地6157亩、房屋994栋，为系列项目实施提供了有利条件。