《办法》中的一大亮点是要求相关企业、合作社申报示范基地必须通过环保关。其中，申报种养结合类、水产类、农产品加工物流类示范基地均要求环保设施完善并通过环评及环保验收；申报种养结合类示范基地还特别要求推行生态循环农业模式，配备生态循环的生产设施设备。

　　申报畜禽类和休闲农业类示范基地，对生态环境保护有着更高的标准要求。其中，申报畜禽类示范基地需实行规模化生产，沼气、粪污无害化处理及动物防疫监测设施设备配套齐全，粪污处理利用率90%以上，环境清洁卫生，通过环评及环保验收。休闲农业类示范基地，则需排污、卫生、安全等符合有关规定，集生产、生态、生活于一体。