马晓光强调，李明哲犯颠覆国家政权罪，犯罪事实清楚、证据确凿充分，有组织、有计划、有行动。台湾有些人无视事实，一味攻击大陆，这才是对两岸关系的严重伤害。李明哲所作所为是否危害大陆的安全与稳定，应由大陆法律判定，而不是由台湾当局和一些政治组织的主观偏见判定。
他表示，尊重彼此对发展道路和社会制度的选择，是两岸之间发展关系的起码底线。我们尊重台湾现有的社会制度和台湾同胞的生活方式，但这并不意味台湾方面可以把自己的政治理念强加给大陆，也不意味台湾个别人打着“民主自由”的幌子就可以随意触犯大陆法律。绝大多数台湾民众会有这样的“同理心”。
马晓光说，由于历史原因，两岸选择了不同发展道路。台湾社会在民进党当局执政下情况如何，相信台湾民众自有切身的感受和判断。大陆在中国共产党领导下，中国特色社会主义事业取得举世瞩目的成就。事实已经证明，我们所走的中国特色社会主义道路最符合广大人民根本利益，得到人民群众衷心拥护，越来越多台湾同胞开始以客观、理性的眼光来看待大陆。
