《方案》指出，科技计划（专项、基金等）是政府支持科技创新活动的重要方式。改革开放以来，我国先后设立了一批科技计划（专项、基金等），为增强国家科技实力、提高综合竞争力、支撑引领经济社会发展发挥了重要作用。但是，由于顶层设计、统筹协调、分类资助方式不够完善，现有科技计划（专项、基金等）存在着重复、分散、封闭、低效等现象，多头申报项目、资源配置“碎片化”等问题突出。

　　《方案》强调，改革要遵循转变政府科技管理职能、聚焦国家重大战略任务、促进科技与经济深度融合、明晰政府与市场的关系、坚持公开透明和社会监督五条基本原则，要强化顶层设计、打破条块分割、改革管理体制、统筹科技资源，加强部门功能性分工。

　　《方案》提出，建立公开统一的国家科技管理平台，构建科技计划（专项、基金等）管理新机制。建立联席会议制度，加强部门间的统筹和协同；依托专业机构管理项目，把政府部门从项目的日常管理和资金的具体分配中解放出来，提高管理的科学化、专业化水平；建立战略咨询和综合评审委员会，切实发挥专家对政府决策的咨询作用；建立统一的评估和监管机制，提高科技投入的绩效；完善国家科技管理信息系统，加强信息公开和社会监督。

　　《方案》要求，遵循科技创新规律和经济社会发展需求，优化形成新的五大类科技计划（专项、基金等）布局体系。面向基础研究和科学前沿探索部署国家自然科学基金；聚焦国家重大战略产品和产业化目标，部署国家科技重大专项；针对事关国计民生的重大社会公益性研究，以及事关产业核心竞争力、整体自主创新能力和国家安全的重大科学技术问题，部署国家重点研发计划；发挥财政资金引导作用，安排技术创新引导专项（基金），促进科技成果转移转化和资本化、产业化；安排基地和人才专项，提升我国科技创新的基础能力。

　　《方案》明确了改革的实施进度，提出按照整体设计、试点先行、逐步推进的原则，经过三年的改革过渡期，到2017年，全面完成改革，按照优化整合后的五类科技计划（专项、基金等）运行，并建成公开统一的国家科技管理平台。

　　《方案》强调，科技计划（专项、基金等）管理改革工作是实施创新驱动发展战略、深化科技体制改革的突破口，任务重、难度大，要统一思想、狠抓落实、协同推进相关工作，确保改革取得实效。