清华大学2016年领军人才选拔全部实行个人自荐，学生不受自身文理分科限制进行专业类申请，每人最多允许填报5个专业，最终认定结果将根据学生申请表所填志愿及测试成绩具体至专业类，并在高考后根据学生认定专业类进行录取。

　　4月10日报名结束后，清华大学将组织学科专家组对学生提交的申请材料进行初评。根据高中学习发展特点及全过程表现，包括平时学业成绩、学科获奖情况、参与课外研究或学习的情况、科技发明/文学创作/创意创新成果的情况、文体特长情况、参与社会工作/社团活动/社会实践/志愿公益活动的情况、综合获奖及突出事迹的情况、个人陈述及推荐情况等多方面进行综合评审。

　　5月初将公布初评结果。初评结果将在报名系统内公布，并在清华大学本科招生网、教育部阳光高考平台公示。

　　初试、复试均安排在高考后举行，其中初试时间预计为6月10日左右，复试预计6月16日左右在清华校内举行。

　　2015年，针对自主招生首次放在高考后进行的新形势，清华大学克服种种困难，在全国开设30个笔试考点供考生自由选择，并与其他高校测试时间错开，充分保障了学生的选择权，2016年将再次实行这一政策。

　　针对考生关心的初试科目安排问题，清华大学也给出了明确方向，报考理科类专业的学生需测试数学与逻辑、物理探究，报考文科类专业的学生需测试数学与逻辑、阅读与表达。

　　2016年，清华大学将继续在复试阶段针对经济管理、建筑学、医学、药学、英语等学科/专业开展特色选拔测试，此外还新增了新雅书院及汽车造型与车身设计方向两个新的项目。