何琦教授一手创立的海南疟疾研究站，为全国的防治疟疾工作培养了大批人才，研究站被誉为我国培养抗疟技术人员的“黄埔军校”。

　　“解放后父亲致力于培养抗疟干部。”何琦的女儿何燕生说，海南疟疾研究站建站第一年就承办了两个防疟人员训练班，一个是高级班，学员来自全国各地；一个中班级，学员来自两广。到了1956年底，该站已在海口和兴隆举办了疟疾防治训练班6期，其中高级班3期、中级班2期、初级班1期，共培训了来自全国20个省份的疟疾防治专业人员350人。

　　1956年的某一期训练班有苏联代表团参加，卫生部防疫司司长和广东省卫生厅防疫局局长都参加了。苏联代表团团长伊沙耶夫院士和何琦以及海南疟疾研究站的疟疾专家刘吟龙、任道性、盛伯粱、杨新史等教授共同授课。在卫生部和广东省卫生厅的支持下，训练班在二十世纪五六十年代连续举办，为全国各地培养了大批的抗疟工作的领导骨干、技术骨干和基层干部。

　　在训练班上，何琦对学员和青年科学工作者进行了多次讲话，敦敦教诲。“从这些讲话中，可以看到父亲对抗疟干部所寄予的殷切期望。”何燕生说，自己的父亲希望大家通过学习，不仅在业务知识上掌握抗疟工作所必需的整套基础知识和基本技术， 更能建立起对抗疟工作的信心和感情，坚定抗疟意志。在办学的指导思想上，何琦特别强调两点，一是培养学员的独立思考和独立工作能力。在培训学员的野外实习阶段，采取一种崭新的教学方法，就是放手让学员独立工作，达到理论与实践相结合的效果。第二是强调人人要参加实际工作，要参加到行动的队伍中去。强调抗疟工作不能搬教条，不能关起门来作计划。只有自己参加到现场工作中去，才能够发现问题，解决问题；发现错误，纠正错误，只有这样才能不断地提高自己的理论和技术水平。